法院查封是一种法律手段，用于保护当事人的权益并执行司法判决。然而，当涉及已预售商品房的查封时，情况可能会变得复杂。

首先，我们需要明确已预售商品房是指开发商在建筑物竣工前，依法预售给购房人且未办理房屋所有权登记的住宅。购房人预购商品房后，开发商有义务按照约定交付产权。但是，在某些不可预见的情况下，如开发商涉及经济纠纷、犯罪行为等，法院可能会对其进行查封。

然而，并非所有情况下法院都能查封已预售商品房。根据相关法律法规，商品房在房地产权利归属登记前，不能被查封。这意味着，如果开发商已经将商品房纳入到房地产权利归属登记系统中，法院就无法再对其查封。因此，是否能够查封已预售商品房取决于其是否已完成产权登记。

此外，虽然法院可以对开发商查封已预售商品房，但一般情况下会对购房人的权益进行保护。购房合同是购房人与开发商之间的法律文件，其中规定了双方的权益和责任。如果房屋已经预售且合同已生效，法院通常会对购房人的合法权益予以保护，并确保其获得相应的赔偿。

此外，根据相关法律规定，法院查封的目的是为了保证执行结果能够得到彻底执行。如果查封已预售商品房无法实现此目标，法院也可能会采取其他措施来执行判决。例如，可以冻结开发商的银行账户、查封其其他财产等等。

综上所述，法院能否查封已预售商品房取决于具体情况，特别是房地产权利归属登记的状态。但无论如何，法院在实施查封时都必须充分考虑购房人的权益，确保他们能够获得相应的补偿。