小产权房是指房屋产权证颁发时间在2007年12月31日之前、总建筑面积小于140平方米的非商品住房。由于小产权房的产权合法性存在争议，近年来不少小产权房被法院查封的案件频繁出现。

首先，导致小产权房被法院查封的原因之一是产权未明确。小产权房的土地使用权和房屋所有权并非落实到个人名下，所以存在产权不明晰的问题。当其他利益关系涉及到该房屋时，如债务纠纷、拆迁等，容易遭到法院的查封行为。

其次，部分小产权房所在地的规划用途不符合住宅用途，导致违规建设。一些小产权房是在商业区、工业区或农村集体建设用地上建造而成，与当地的规划用途不符。这种情况下，法院有可能会将其查封，要求整改或限制使用。

另外，小产权房存在土地使用权过期的问题。由于小产权房多为农村改造而来，其土地使用权期限常为30年。一旦土地使用权期限到期，未经续期或变更用途，也有可能面临被法院查封的风险。

最后，小产权房存在违法建设问题。一些开发商或个人在建造小产权房时，可能会违反相关的建设规定，如未按照国家标准进行设计、建设，或者无证建造等。这样的违法行为往往会引起政府部门的关注，并导致法院对该房屋予以查封。

总之，小产权房因其产权不明确、规划用途不符、土地使用权过期或违法建设等问题，容易成为法院查封的对象。对于购买或拥有小产权房的个人来说，需谨慎了解相关法律法规，防止自身利益受到损害。