随着经济社会的发展，农村房产成为越来越多农民的重要财产。然而，在一些特殊情况下，法院会采取冻结措施对农村房产证进行处理。那么，法院会冻结农村的房产证吗？本文将从法律角度解析该问题。

首先，需要明确的是，法院冻结房产证是为了保全诉讼标的物。在司法程序中，当某些案件涉及到农村房产的权益争议，为保证争议双方的合法权益不受损害，法院可以根据相关法律规定采取冻结措施，以确保诉讼结果的有效执行。

其次，法院冻结农村房产证的具体程序如下：当争议双方提起诉讼或申请仲裁时，法院或仲裁机构会根据案件性质和具体情况，判断是否需要冻结涉及到的农村房产证。如果法院认为有必要冻结，将会向相关不动产登记机构发送《冻结通知书》，要求对该房产证进行冻结。

需要注意的是，法院冻结房产证并不意味着该房产所有权发生变更，更不意味着农村房产的使用权被剥夺。冻结只是暂时限制了房产证的处置、转让和抵押等行为，目的是确保案件的胜诉方能够顺利执行判决结果，维护当事人的合法权益。

此外，在法院冻结期间，农村房产的日常管理和效益仍归属于房产所有人。也就是说，冻结并不会影响房产的正常使用，农民依然可以继续在自己的房产上生活和经营。

最后，冻结决定的解除是由法院根据案件的实际情况来决定的。一般情况下，当涉及的问题得到解决或者相关诉讼案件完成时，法院会解除对农村房产证的冻结措施，并将解封通知书送达至登记机构，使之恢复正常状态。

综上所述，法院在特定情况下会采取冻结措施来保全农村房产证。冻结并不意味着剥夺农民的产权和使用权，而只是为了确保案件结果的有效执行。法院将根据实际情况解除冻结，并使房产证恢复正常状态。