法院是否有权冻结林权证一直是一个备受争议的问题。在我国，林权证被视为一种财产权利证明，拥有林权证意味着享有相应的合法权益。

然而，根据相关法律规定，法院确实拥有冻结财产的权力。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第237条规定，当事人申请财产保全时，法院可以裁定冻结或者查封被执行人的财产。由于林权证也被视为一种财产，所以法院在特定条件下是有权冻结林权证的。

具体来说，法院冻结林权证通常是在涉及治安案件、刑事案件、民事案件或走私等违法活动调查阶段使用的手段。例如，在一起非法砍伐森林的案件中，如果法院认为林权证可能是违法行为的证据之一，就可能会冻结该林权证，以便进行进一步的调查和审理。

当然，对于法院是否冻结林权证还有一些限制和条件。首先，法院必须经过合法程序，依法作出相关冻结决定。其次，冻结林权证的目的必须是为了保护公共利益、维护社会秩序，或者确保执行判决、裁定的效果。

此外，法院冻结林权证的措施也有时效性。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第102条的规定，财产保全期限一般不得超过三个月。如果超过这个期限，需要重新申请续展。因此，尽管法院有权冻结林权证，但冻结的时间是有限制的。

最后，需要强调的是，法院冻结林权证只是一种暂时措施，并不等于剥夺了真正的所有权，也不代表被冻结的林权证失去价值。在案件结束后，如果没有作出相关判决，法院应当解除冻结，以保障当事人的合法权益。

综上所述，虽然法院有权冻结林权证，但冻结是有条件和期限的，并且必须经过合法程序。法院的冻结决定旨在维护公共利益和司法公正，而非剥夺当事人的合法权益。