医疗纠纷是社会中常见的一种争议，由于涉及医生和患者之间的权益关系，往往牵扯到巨额赔偿和法律责任。当医疗纠纷无法通过协商解决时，可能需要诉诸法院司法程序。

在处理医疗纠纷案件时，法院拥有一系列的措施来保证案件的公正审理和相关方的利益得到保护。其中一项重要的措施就是冻结存款。那么，医疗纠纷法院能否冻结存款呢？答案是可以。

根据我国现行的《民事诉讼法》规定，当申请人认为被申请人因不正当得到财产、转移财产或者以其他方式将目标财产所在地改变而导致申请人行使权利受到实际损害时，可以向法院申请对被申请人财产采取保全措施，其中包括冻结存款。也就是说，在医疗纠纷案件中，当申请人主张医生责任，并证明被申请人将财产以不正当方式进行转移时，法院有权冻结被申请人在银行中的存款。

法院冻结存款的目的主要是保障申请人的权益，以防止被申请人通过将财产转移来逃避赔偿责任。一旦法院冻结了被申请人的存款，被申请人的资金流动将受到限制，无法自由支配和动用这部分资金。这样一来，即便医疗纠纷案件没有最终审理结果，申请人也可以通过冻结被申请人的存款来保护自己的利益。

当然，法院冻结存款并不意味着被申请人就无法使用这些被冻结的资金。在执行过程中，被申请人可向法院提出解除冻结的申请，并提供相关证据和担保措施，如果法院认为被申请人提供的证据和担保足够可靠，可以解除对存款的冻结。

总之，在医疗纠纷案件中，法院有权冻结被申请人的存款来保护申请人的权益。这一措施的出现，使得医疗纠纷案件更加公正和可执行，保护了广大患者的合法权益。