法院在执行刑事案件、民事案件以及行政案件的过程中，经常需要对涉案车辆进行查封。查封车辆是一种保全措施，它可以确保财产不被转移或者变卖，从而保障债权人的利益不受损失。然而，如何实际控制查封车辆，确保查封措施的有效执行，却是一个非常重要的问题。

首先，法院在实际控制查封车辆时，需要依法办理查封手续，并出具相关的查封决定书。这是保障查封车辆合法性和有效性的前提。查封决定书包括查封车辆的详细信息、被查封财产的具体情况、查封措施的内容等，可以作为查封执行的依据。同时，法院还应当将查封决定书送达给相关方，确保他们知晓并遵守法院的决定。

其次，法院还需采取相应措施，确保查封车辆得到有效保管。根据我国《刑事诉讼法》的规定，被查封物品由当地公安机关责任保管，保证被查封物品的安全性。公安机关应当制定相应的管理措施，将查封车辆妥善保管，并防止任何人非法操作或移动被查封车辆。

另外，法院还可以委托第三方保管公司负责查封车辆的保管工作。第三方保管公司可以提供专业的仓储设施和安全保障服务，确保查封车辆不受损失，并保证查封期间相关程序的合法性。同时，法院也需要加强对第三方保管公司的监督，确保其按照法律规定履行查封车辆保管的义务。

此外，在实际控制查封车辆过程中，法院还需与相关部门进行有效协调和沟通。例如，如果被查封车辆存在交通违法行为，法院需要与交通管理部门进行联络，以确保被查封车辆在查封期间不再违法。法院还可以与相关保险公司进行合作，确保查封期间的保险问题得到妥善解决。

最后，法院还可以通过先行登记等方式来进一步加强对查封车辆的实际控制。通过对被查封车辆的相关信息进行登记，可以阻止车辆所有人进行非法处置或转移。同时，法院还可以对被查封车辆进行日常监管，确保其状况良好，并采取必要措施防止被查封车辆的损毁。

综上所述，法院在实际控制查封车辆时，需要依法办理查封手续并出具查封决定书；同时，采取相应措施确保查封车辆的有效保管；加强与相关部门的协调和沟通；以及通过先行登记等方式进一步加强对查封车辆的控制。这些措施的有效实施，能够确保查封车辆措施的合法性和有效性，从而维护相关利益人的权益，保证司法执行的顺利进行。