专项账户是指企业或组织为特定目的设立的用于管理资金的账户，通常与法律法规有关。在中国，专项账户被广泛应用于各个领域，如基础设施建设、教育事业、福利医疗等。

对于专项账户的法院查封问题，我们需要从专项账户的性质和法院查封的情况来进行分析。专项账户的资金是用于特定用途的，因此如果企业或组织违反了使用规定，导致造成经济损失或违法行为，那么法院是有权对专项账户进行查封的。

法院查封专项账户的目的是保护利益相关方的权益，确保专项资金的安全和正确使用。尤其对于一些大型的专项账户，涉及到重要的社会利益和公共利益，法院会更加谨慎地对待，并严格审查违规行为后才做出查封决定。

但是，法院并非所有时候都会对专项账户进行查封。在某些情况下，法院可能会采取其他措施，如冻结账户等，以防止企业或组织将资金转移或挪用。这也是为了保证专项资金的安全和有效使用。

此外，要注意的是，法院查封专项账户并不影响专项账户内的正常业务运作。法院查封专项账户后，资金仍然可以按照规定使用，并且相关项目的进行也不受到太大影响。只有在经过法院审查判决后，才会产生具体的惩罚措施。

对于企业或组织来说，遵守专项账户的使用规定是非常重要的。只有合理规范和正确使用专项资金，才能避免触犯法律法规，也能保护自身的利益。同时，建立完善的内部管理制度和监督机制，可以有效避免专项账户被法院查封的情况发生。

总之，法院是否会查封专项账户主要取决于违规情况的严重程度和专项账户涉及的社会利益大小。法院在进行查封时会综合考虑各种因素，以保护利益相关方的权益为前提，确保专项资金的安全和有效使用。