房屋抵押是很常见的一种方式，借款人可以将自己拥有的房屋作为抵押物向银行贷款。然而，在进行房屋抵押后，一些借款人会担心法院是否有权对其抵押房屋进行查封。

根据我国《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院在某些情况下确实有权对已抵押的房屋进行查封。首先，如果借款人欠还了贷款，并且银行提出申请请求，经过法院审理后，法院有权对抵押房屋进行查封。这是维护借款人与银行合法权益的一种手段。

其次，如果借款人违反了相关借款协议的约定，如未按时偿还本金和利息，银行有权要求法院对抵押房屋进行查封以保障其合法权益。当然，在此之前，银行需要提前向借款人发出催告通知，要求其履行还款义务。

但是，需要注意的是，法院查封抵押房屋并非一种常见的手段。通常情况下，法院更倾向于采取其他方式，如强制执行、拍卖等来解决纠纷。毕竟，对借款人和银行来说，查封房屋是一种极不利的情况，会带来很大的损失。

此外，根据《中华人民共和国物权法》的规定，不动产登记系统中抵押权的设立需要进行登记。只有进行了合法登记后，债权人才能取得相应的抵押权并对其实施有效的保全。如果抵押权未进行登记，法院也就无法对其进行查封。

因此，总结来说，房屋抵押后，法院确实有权对其进行查封，但这并非常见情况。在具体操作过程中，法院更倾向于采取其他解决措施。此外，在办理抵押手续时，借款人应当注意相关法律法规的规定，确保自己合法权益的保护。