预抵押登记是指在办理房屋抵押贷款时，银行或其他金融机构为了保护自己的利益，提前在房屋登记簿上做出的一种登记。预抵押登记的目的是为了保障借款人在未来办理房屋抵押贷款时能够享受到优先权，确保自己的债权能够得到优先清偿。

然而，预抵押登记并不意味着房屋已经真正抵押给了银行或金融机构。预抵押登记只是一种权利凭证，是表明借款人有意向将房屋作为抵押物的一种登记。从法律上讲，预抵押登记并不能产生任何法律效力，也不能对第三人产生约束力。

所以，一般情况下，法院是可以对预抵押登记的房屋进行查封的。查封是指法院根据法律规定，对被执行人的财产进行限制使用或者限制处分的一种强制措施。当有人以拖欠债务等原因被法院判决时，法院可以依法对该人的房产进行查封，以保障债权人的利益。

尽管预抵押登记并不具备抵押物的法律效力，但法院在查封房屋时通常会一并查封已登记的预抵押权利。这是因为预抵押登记是表明借款人有意向将房屋作为抵押物的登记，也是表明借款人与银行或金融机构之间存在债权债务关系的一种凭证。

当房屋被法院查封后，预抵押权利人如果要继续行使自己的权利，需要通过与法院联系，提供相关材料证明自己的权利。一般情况下，法院会根据相关法律及证据来判断预抵押权利人的权益是否受到保护。

总之，虽然预抵押登记不能对第三人产生约束力，但在房屋被法院查封时，通常会一并查封已登记的预抵押权利。预抵押权利人在此情况下需要通过法院提供相关证明材料，以保障自己的权益得到保护。