随着社会的发展，人们的生活水平逐渐提高，对健康保障的需求也越来越迫切。农村合作医疗（农合）作为一种农村居民的基本医疗保险制度，得到了广大农民的认可和支持。然而，在一些地方，由于各种原因导致农合资金管理不善，甚至存在挪用、侵吞等违法行为。这就引发了一个问题：法院会不会冻结农合资金？

首先，根据我国法律规定，法院是独立的司法机关，其职责是保护国家法律的尊严和实施公正裁判。如果发现某个农合管理单位存在挪用、侵吞农合资金的行为，法院有权介入并采取相应措施，包括冻结涉案资金。农合资金属于公共利益财产，任何单位或个人不得擅自使用或挪用。

其次，农合资金是为农民提供基本医疗保障的重要资金来源，冻结农合资金将直接影响到农民的医疗保障权益。因此，法院在冻结农合资金时必须慎重考虑，确保不影响正常的医疗服务和农民的利益。

最后，为了有效保障农民的权益，预防农合资金被侵占，农合管理单位应建立健全的资金管理制度，加强内部监督和审计，及时发现和纠正违法行为。同时，社会各界也应当积极监督，对发现的违法行为及时举报，共同维护农民的合法权益。