近年来，随着建设工程的不断增多，工程合同纠纷也时有发生。当双方在合同履行过程中发生争议，其中一方为了维护自身权益，往往会通过法院起诉对方。而在诉讼过程中，有些当事人会担心法院会冻结工程资金导致工程无法继续进行。

事实上，法院在处理工程合同纠纷时，并不会轻易冻结工程资金。首先，法院会在立案前进行调解，希望双方能够通过协商解决纠纷，避免诉讼。如果调解无果，法院会依法受理案件，但冻结工程资金是法院最后考虑的手段。

法院会冻结工程资金的情况一般是在以下几种情形下考虑：一是当事人恶意转移、隐匿财产，导致对方无法执行判决，法院可能会冻结工程资金以保障执行效果；二是当事人拒不履行法院裁定或判决，法院为强制执行而冻结工程款项。

因此，对于正当诉讼的当事人而言，不必过于担心法院会轻易冻结工程资金。遵守合同约定、诚实守信是避免工程资金被冻结的最好方法。