公安机关和法院在执法过程中都可能会涉及到冻结股权的情况，但二者在冻结股权的方式和程序上存在一些区别。

首先，公安机关冻结股权通常是在刑事案件中进行的。在侦办刑事案件过程中，公安机关可以根据需要对涉案人员的股权进行冻结，以防止其通过股票交易等方式转移、隐匿涉案资产。公安机关冻结股权的程序相对简单，主要是通过调取证券交易信息和银行账户信息，向证券公司和银行发出冻结通知，并通知涉案人员配合配合实施冻结。

法院冻结股权则是在民事或行政诉讼中进行的。当当事人在诉讼中涉及到财产纠纷，且有可能通过转移、变卖股权等方式逃避债务或判决执行时，法院可以依法对当事人的股权进行冻结。法院冻结股权的程序较为严格，需要依法申请并获得法院批准，才能向证券公司和银行等机构发出冻结通知。

另外，公安机关冻结股权属于强制措施，公安机关拥有较大的自由裁量权，可以先行冻结涉案人员的股权，而无需经过法院审批。但公安机关冻结的有效期相对较短，一般为6个月，需要及时报请法院确认。而法院冻结股权则需要经过法院的审批和监督，程序较为繁琐，但冻结的有效期会相对较长，一般为2年。

总的来说，公安机关和法院在冻结股权方面的程序和权限存在一定的差异。公安机关主要是在刑事案件中进行冻结，程序较简单但有效期较短；法院主要是在民事或行政诉讼中进行冻结，程序较为繁琐但有效期较长。双方在执法实践中应当根据具体情况选择合适的方式进行股权冻结，确保案件的顺利侦办和资产的有效保全。