在房地产交易过程中，抵押权是一种常见的担保方式。借款人将房屋作为抵押物，向银行或其他金融机构借款。如果借款人无法如期还款，银行有权将抵押物进行处置，以偿还债务。而法院查封则是司法机关根据法律规定，对被告财产采取保全措施，限制被告处分或转让财产。

在某些情况下，抵押权与法院查封之间可能会出现冲突。例如，当抵押权人要求处置抵押物时，却发现该房产已被法院查封。这时，抵押权人与法院之间可能会产生纠纷。抵押权人可能会主张自己的权利优先于法院查封，而法院可能会认为查封是为保护债权人利益而采取的必要措施。

在这种情况下，抵押权人需要通过法律途径来维护自己的利益。他们可以向法院提起诉讼，请求解除对抵押物的查封以便行使自己的权利。法院在审理此类案件时，会综合考虑抵押权人和债权人的权益，以及案件的具体情况和法律规定。

在实际操作中，抵押权人需要充分了解法律规定，并准备充分的证据来支持自己的主张。同时，抵押权人也可以寻求法律咨询或委托律师代理自己的诉讼事务，以提高胜诉的几率。

总的来说，抵押权与法院查封之间的纠纷并不罕见。双方需要通过法律途径来解决分歧，以保护各自的合法权益。只有在公平公正的法律程序下，才能达成双方都能接受的解决方案。