法院查封房产是一种法律手段，旨在保护债权人的合法权益。但是，如果法院查封时间过长，超过法律规定的期限，就会面临违法问题。那么，法院查封三年违法吗？

根据我国《土地管理法》规定，法院查封房产的期限一般为一年，经法院批准可以延长至两年。超过这一期限，法院必须解除查封，并将查封期间的收益返还给被查封人。因此，如果法院查封超过三年，就会违法。

对于法院查封期限过长的情况，被查封人可以向法院提出解除查封的申请，要求法院依法处理。同时，被查封人还可以向有关部门投诉，维护自己的合法权益。

总之，法院查封房产是一项重要的法律措施，但是法院在执行查封时也必须遵守法律规定的期限，超期查封是违法行为，应该及时解除。