法院查封机械设备后，一般会通过拍卖的方式进行处理。拍卖是一种比较公开透明的方式，可确保查封物品的最大价值被实现，也能保障相关利益方的合法权益。

首先，法院会委托专业的拍卖公司或者拍卖机构进行拍卖，确保整个过程的公平公正。在拍卖之前，会对机械设备进行评估，确定其价值和估价，作为拍卖的起始价。一般来说，起拍价会低于市场价格，以便更快地成交。

拍卖的方式有很多种，可以是现场拍卖、网络拍卖或者电话拍卖等。参与拍卖的人员也有不同，可以是个人、企业或者其他机构。拍卖过程中，参与者可以根据自己的需求和价值判断出价，最终以最高价者成交。

拍卖成交后，买家需要支付拍卖款项，并办理相关手续完成交割。拍卖公司会协助办理过户手续，确保买卖双方的权益得到保障。如果出现纠纷或者问题，可以向法院申诉或者诉讼，维护自己的合法权益。

总的来说，法院查封的机械设备通过拍卖的方式进行处理，能够有效保障相关权益的合法性和有效性。拍卖是一种公开透明的交易方式，能够最大程度地实现查封物品的价值，也有利于维护相关利益方的合法权益。