法院查封保证金是指在特定情况下，法院对被申请执行财产采取查封措施前，要求申请人缴纳一定金额作为保证金。

查封是一种法律手段，是指法院为保障债权人的利益，采取一定措施对财产进行限制，防止财产在执行程序中被转移、损坏或灭失。查封的措施包括财产查封、冻结、扣押等。

申请执行人申请法院对财产进行查封时，法院常常会要求申请人支付一定金额的保证金。保证金的目的是保障被申请执行人的权益，以防止申请人恶意滥用法律手段，对被申请执行人造成不必要的损失。

根据我国《民事诉讼法》的规定，保证金的数额由申请执行人根据被申请执行人的财产情况、案件性质和紧急程度等因素自行决定。法院只是对保证金的数额进行审核，并依据申请人的决定作出裁定。

保证金的收取方式一般有两种，一种是直接缴纳给法院，另一种是通过银行保证书或担保公司提供保证金。无论通过何种方式缴纳，保证金一般要在查封措施执行完毕后，才能根据法院的决定予以返还。

在一些特殊情况下，法院可能会决定不收取保证金。例如在被申请执行人具备一定信用保证或案件性质不复杂、涉及金额较小的情况下。但这种情况比较少见，一般情况下法院都会要求申请人支付一定数额的保证金。

如果申请人拒不支付保证金或支付不足的，法院可以根据情况决定不予受理或予以中止、撤销已经受理的案件。同时，申请人还可能面临违规操作的法律责任。

总之，法院查封保证金是为了保障被申请执行人的权益，防止申请人滥用法律手段。申请执行人需要根据被申请执行人的财产情况和案件性质等因素，自行决定保证金的数额，并按照法院的要求进行缴纳。只有在查封措施执行完毕后，根据法院的裁定，保证金才能予以返还。