专项资金是指国家、地方、行业部门或政府特别规定用于特定领域或项目的资金。专项资金往往具有专门的管理机构和使用规定，用于支持特定领域的发展或项目的实施。在司法领域，专项资金的使用和监督也受到一定的规定和限制。

法院在处理案件时，有时会涉及到被告方的财产冻结措施。财产冻结是指法院依法对被告方的财产采取限制性措施，以确保案件胜诉后能够及时执行判决。对于专项资金，法院在适用财产冻结措施时也需要考虑其特殊性。

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，专项资金一般具有较强的使用、管理和监督制度，一旦专项资金被划拨或使用，就应按照相关规定进行专款专用，并接受相应的监督和审计。因此，法院在适用财产冻结措施时，应根据专项资金的使用规定和管理制度，避免影响专项资金的正常使用。

另外，专项资金往往用于支持特定领域或项目的发展，对其冻结可能影响相关领域或项目的正常运作。因此，在适用财产冻结措施时，法院需要权衡双方的权益，避免因冻结专项资金而给相关领域或项目带来不必要的损失。

综上所述，专项资金虽然也可以受到法院的冻结措施，但在适用时需考虑其特殊性和影响，避免对专项资金的正常使用和相关领域或项目的发展造成不利影响。