私立学校在运行过程中，有时会遇到一些法律纠纷或者经济问题，那么私立学校法院能否对其进行查封呢？这是一个比较复杂的问题，需要从不同角度进行分析。

首先，私立学校作为一个独立的法人实体，具有一定的法律地位和权利。在遇到法律问题时，私立学校可以通过诉讼的方式向法院求助，包括提起诉讼或者应对被诉讼。在法院裁定下，私立学校应该按照法院的要求履行相关责任和义务。

其次，法院在处理私立学校案件时，会根据具体情况决定是否需要进行查封。查封是法院在一定条件下对被告财产进行限制处理的一种措施，目的是防止被告转移、毁损、变卖或者掩饰财产，以确保原告获得赔偿或者其他法律目的的实现。

对于私立学校来说，如果私立学校在法律诉讼中败诉并且无法履行法院裁定的义务，法院可能会考虑对其财产进行查封。但是，需要注意的是，一般情况下法院会优先采取其他弥补措施，比如冻结财产、罚款等，只有在其他措施无效时才会考虑查封。

综上所述，在私立学校法院案件中，法院是有权对私立学校进行查封的。但是，这种情况并不是很常见，一般只会发生在私立学校严重违法违规，且无法进行其他弥补措施的情况下。因此，私立学校在经营管理过程中需要合法合规，遵纪守法，以避免出现不必要的法律风险。